Třezalka tečkovaná je sice účinnou bylinou, nicméně pro její použití existují mnohá úskalí. Neměla by se totiž kombinovat s mnoha léčivy, a to např. s antidepresivy, léky na cholesterol anebo proti viru HIV. Kromě toho může snižovat účinnost hormonálních antikoncepčních přípravků.