Gastrocentrum Karlovy Vary poskytuje lékařské služby také v rámci proktologie. V proktologické ambulanci řeší lékaři potíže pacientů s nemocemi řiti a konečníku – infekcemi, záněty, nádory, ale i poraněními apod. K nejčastějším problémům pacientů přicházejících na proktologii však patří hemeroidy a anální fissury.