Projevy histaminové intolerance mohou připomínat skutečnou alergickou reakci. Zahrnují například svědění, bolesti hlavy, návaly horka, závratě, nevolnost, trávicí obtíže, podrážděnost, pálení v očích, rýmu a celkovou únavu. Mezi další příznaky patří nespavost, psychické problémy, ale i poruchy chování.