Léčba fibrilace síní chirurgickou metodou se provádí již řadu let, obvykle jako součást operace na srdeční chlopni nebo chirurgické revaskularizace. V tomto případě je přístup k srdci zajištěn otevřením hrudní kosti. Cílem je nastolení správného srdečního rytmu a obnovení mechanické funkce srdečních síní.