Je to malé odplivnutí pro člověka, ale veliký krok pro lidstvo. V ruce držím drobnou zkumavku, na jejímž dně se třpytí dva mililitry důkazního materiálu o tom, zda jsem, nebo nejsem nakažen nemocí covid-19.
Nikdo mi nemusel strkat do nosu tyčinku pro stěr nosohltanu, což je dnes standardní metoda pro detekci koronaviru v těle. Tady v molekulární biologické laboratoři českého biotech startupu DIANA Biotechnologies k vyšetření postačí jen a pouze to, že plivnu do zkumavky.
Forbes získal exkluzivní možnost vyzkoušet přelomovou metodu PCR testů na koronavirus ze slin, která je v tuto chvíli v závěrečné fázi testování. Během dvou týdnů bude dokončena finální studie, při níž se přesnost těchto testů porovnává s účinností „tyčinkových“ testů. Koncem měsíce mají být podle plánu testy ze slin nasazeny na prvních odběrových místech.
„U testů ze slin je klíčové, že jejich mnohem rychlejší a jednodušší odběr umožní mnohem vyšší kapacitu odběrových míst,“ vysvětluje spoluzakladatel DIANA Biotechnologies a její provozní a finanční ředitel Martin Dienstbier.
„Teď je kapacita limitovaná počtem kvalifikovaného personálu, který je schopný vykonat stěr z nosohltanu,“ konstatuje. U odběrů ze slin už specificky školený personál nebude potřeba a nasazení slinových testů umožní dále navýšit celkovou kapacitu testování v Česku.
„První měsíc budeme schopni dodat jen asi 100 000 testů, ale už začátkem příštího roku bychom měli dodávat jeden až dva miliony testů měsíčně. Odebrat sliny je mnohem jednodušší, naplivat do zkumavky zvládne skoro každý.“
Test budou navíc lidé absolvovat ochotněji než mnohdy nepříjemné šťourání tyčinkou kdesi na pomezí lebečních kostí a mozku. Změna v revolučním přístupu DIANA Biotechnologies se přitom odehrává nejen co do formy odběru, ale i v rámci detekování viru.
„Standardní test má dvě části – první je izolace virové RNA a druhou je metoda PCR,“ vysvětluje druhý zakladatel firmy a její jednatel a technický ředitel Václav Navrátil. „Náš test by měl umožnit obě tyto oblasti vylepšit tím, že se zjednoduší PCR detekce viru, a tak už nebude potřeba izolovat jeho RNA.“
Toto zjednodušení se přitom netýká jen výsledků odběru ze slin, ale i ze stěrů z nosohltanu, jichž dnes technologie DIANA Biotechnologies pokrývá přibližně čtvrtinu české kapacity.
K vyhodnocení testu dojde během hodiny, což z něj – současně s nenáročností odběru – dělá ideální formu screeningových a plošných testování. „Je možné, že zatímco v prostředí nemocnic se bude u příznakových pacientů dále využívat spíše test ze stěru, test ze slin budou využívat třeba firmy, které potřebují testovat své zaměstnance třikrát do týdne,“ doplňuje Navrátil.
Stejně tak je možné test ze slin v první řadě čekat u screeningu asymptomatických lidí nebo u tolik potřebného a častého testování potenciálně nakažených lidí v klíčových sektorech typu zdravotnictví. Kvůli jednoduchosti odběru a možnosti rychlého automatizovaného zpracování by pak bylo možné jeho nasazení v plošném testování určitých regionů či částí populace.
Firma DIANA Biotechnologies, kterou stála investice do vývoje testů na koronavirus už nižší desítky milionů korun, se ještě na začátku roku věnovala primárně své ambici stát se velkou farmaceutickou firmou na způsob globálního Roche.
Před koronavirem se v DIANA Biotechnologies vyvíjela zejména laboratorní diagnostika a rozjížděl se tu raný vývoj léčiv a protilátek. „Umíme toho prostě mnohem víc než dělat PCR diagnostiku,“ říká Navrátil. S úderem korony ale firma provedla s posvěcením investorů riskantní krok a soustředila se na vývoj testů.
„Byznysově nám testy na koronavirus přinesly významné tržby mnohem dříve, než jsme je původně plánovali,“ dodává Dienstbier, „ale veškerý zisk použijeme na akceleraci našich dalších vývojových projektů.“ Ty jsou v současné chvíli „na čekačce“, ale jen co bezodkladnost koronavirových testů opadne, bude v nich DIANA Biotechnologies pokračovat.
Test ze slin v šesti krocích
1. Už žádné slzy!
Test vyžaduje jen drobné plivnutí do zkumavky vybavené trychtýřkem. Skutečná podoba zkumavek ještě není veřejná kvůli probíhajícímu patentování, toto je prototyp. V principu ale funguje stejně, jako bude fungovat brzy patentovaný testovací set. Jen je o trochu humpoláčtější – zkumavky budou menší.
2. Plivání povoleno
Člověk dostane
zkumavku s trychtýřkem a podle jednoduchých instrukcí do ní
plivne. Trychtýřek odhodí, zkumavku zašroubuje. Pak už je to v
rukou odběrového místa. Zkumavka se zasune do stojánku společně
s dalšími pětadevadesáti zkumavkami a putuje do laboratoře.
3. Čekání na robota
Robot, jako je v tomto případě Agilent Bravo, všechny zkumavky najednou odšroubuje, multikanálovou pipetovací hlavou přenese vzorek do PCR destičky a přidá chemikálie a enzymy potřebné pro analýzu. Laboratoře vybavené roboty budou moci zpracovat pět až deset tisíc vzorků denně. Tento krok budou v neautomatizovaných laboratořích provádět laborantky a laboranti a bude jim trvat jen o trochu déle.
4. Řetězová reakce
Připravených 96 vzorků následně putuje do PCR přístroje, který do hodiny zjistí to, co nás zajímá nejvíce – totiž zda vzorek obsahuje, nebo neobsahuje koronavirus. Platíčko se vzorky se do něj zasune trochu jako cédéčko do staré CD mechaniky u počítače a proběhne polymerázová řetězová reakce; stroj při ní zvyšuje a snižuje teploty, což přinutí enzymy, které v reakci jsou, namnožit tu část virové RNA, kterou chceme detekovat.
5. Chvíle napětí
Pokud ve vzorku virus je, tak v každém jednom cyklu zdvojnásobí počet molekul virové DNA; nárůst je pak vidět na grafu odrážejícím fluorescenční vizualizaci viru. Čím větší koncentrace viru se ve vzorku nachází, tím dříve se křivka pohne směrem vzhůru.
6. Happy end
Jsme negativní. A
přejeme to i vám. Be negative, stay positive!
Místo výtěru z nosohltanu testy ze slin nebo kloktací. Nové metody odběru mohou pomoci v boji s pandemií
Metody odběrů vzorků ze slin a pomocí kloktání mohou nahradit běžný a pro mnohé nepříjemný výtěr nosohltanu štětičkou. Cílí i na ty, kteří podstupují testování pravidelně a opakovaně. Vzorky jsou pak v obou případech vyšetřeny v laboratořích metodou PCR.
Autoři nových postupů zdůrazňují, že komfort odběru je zcela nesrovnatelný s metodami, které jsou používané dnes, tedy odběrem štětičkou z nosohltanu. Oproti nim jsou mnohem méně bolestivé a mohou tedy k testům přivést i lidi, kteří by se jinak otestovat nenechali.
Test ze slin
„Nyní finalizujeme uvedení do praxe ve vybraných laboratořích, během ledna by testy měly být k dispozici,“ uvedl k testům ze slin Navrátil. Dodal, že zájem je ze strany státních institucí, firem i veřejnosti.
Společnost nyní dovede připravit statisíce testů měsíčně. „Samotných testů už vyrobíme více, ale postupně nabíhá výroba odběrových sad,“ upřesnil.
Dodal, že o spolupráci společnost jedná primárně s diagnostickými laboratořemi.
Navrátil už dříve řekl, že testy ze slin mají srovnatelnou citlivost s těmi, které využívají standardní postup. „Pozitivních případů bylo ze stěrů odhaleno 105, zatímco ze slin 109,“ uvádí společnost ve zprávě.
Firma je otestovala ve spolupráci s Fakultní nemocnicí Bulovka. Podle vědce také u testů vyvinutých ve Vestci není nutné samostatně izolovat virovou RNA, což je nejtěžší krok analýzy. Výsledná cena bude pro testované zhruba stejná jako u ostatních PCR testů. „Jako výrobci finální cenu neurčujeme, to je v režii laboratoří a pojišťoven,“ dodal Navrátil.
Kloktací test
Pro snazší a šetrnější odběr vzorků u onkologických pacientů trpících problémy se sliznicí byl na Univerzitě Palackého původně vyvíjen test, který využívá kloktání. Podle projektového manažera ÚMTM Petera Vanka ho nyní využívají, nebo o něj mají zájem například umělecké soubory, které podstupují testování opakovaně.
„Klinicky jsme GARGTEST validovali na počtu 459 párových vzorků pacientů a srovnali jsme ho s klasickým výtěrem z nosohltanu. Výsledky standardního odběru se od samoodběru GARGTESTem signifikantně nelišily a byly funkčně srovnatelné, což je výborná zpráva,“ uvedl ředitel ÚMTM Marián Hajdúch.
Podle Lubomíra Němce ze společnosti IntellMed, která produkt vyrábí, nyní firma může vyrobit 70 tisíc až 100 tisíc kusů měsíčně. „Pokud by byla poptávka větší, než je výrobní kapacita, jsme schopni ji v průběhu dvou tří týdnů navýšit na dvojnásobek,“ poznamenal.
Na dotaz ohledně počtu distribuovaných testů Němec uvedl, že jde zatím asi o tři tisíce kusů. „Zahájili jsme to teprve v období vánočních svátků,“ podotkl. Nyní firma řeší spolupráci s laboratořemi připravenými zpracovat takto získané vzorky. Vanek doplnil, že jako nadstandard testování touto formou nabízí také laboratoře v Praze a samoodběrová sada by měla být dostupná také na internetu.
Testy ze slin místo výtěru z nosohltanu. Metoda se začala využívat i v Ostravě
Zakašlat do roušky a pak vyplivnout sliny přes trychtýř do zkumavky. Nový typ testu na covid-19, který je mnohem příjemnější než odběr výtěrem z nosohltanu, se zatím používá v pražské nemocnici Na Bulovce a nově i v nemocnici v Ostravě-Vítkovicích.
Testovací metodu ze slin vyvinula česká vědecká firma Diana Biotechnologies. Zkušební kolo proběhlo loni v listopadu v pražské Nemocnici Na Bulovce a podle zástupců společnosti ukázalo, že testy ze slin mají nejenom citlivost srovnatelnou se standardními metodami, ale zachytily dokonce i o několik pozitivních případů více.
V Ostravě testování zajišťují laboratoře Agellab. U prvních 200 pacientů budou testovat zároveň vzorek ze slin i z nosohltanu.
„Metoda je plně schválená pro klinické použití, přesto jsme se rozhodli na našem pracovišti provést také vlastní interní kontrolu.
V prvních týdnech budeme v rámci pilotního provozu odebírat pacientům jak vzorek ze slin, tak z nosohltanu, abychom mohli výsledky porovnat a ověřit si spolehlivost vyšetření a správnou techniku odběru slin,“ uvedla vedoucí laboratoře klinické mikrobiologie Hana Bílková Fránková.
Testování ze slin je podle ní cenově zhruba srovnatelné s klasickým PCR testem z výtěru z nosohltanu. Nová metoda je ale každopádně pro pacienty výrazně příjemnější. Stačí, aby několikrát zakašlali do roušky a poté vyplivli do malé zkumavky za pomocí trychtýře své sliny.
„Mezi další výhody patří také lepší a delší stabilita vzorku,“ dodala mikrobioložka s tím, že výsledek testu bude dostupný v den doručení vzorku do laboratoře.
Za 14 dní pro veřejnost
Laboratoře také oceňují, že testovací metodu ze slin plně vyvinula česká firma. „Protože se jedná o čistě českou firmu, mohli jsme se spolehnout na to, že veškerý materiál potřebný k testování bude včas k dispozici a zajistili jsme tak vysokou kapacitu testování,“ uvedl Tomáš Gucký, předseda představenstva společnosti Laboratoře AGEL.
„Pilotní provoz plánujeme ukončit v horizontu dvou týdnů a poté budeme moci nabídnout tuto neinvazivní šetrnou metodu klinickým pracovištím i veřejnosti,” dodal.
Nové testy ze slin by měly umožnit i navýšení testovacích kapacit.
Kloktací testy
Na trhu v Česku jsou také testy kloktací, nazvané Gargtest. Tento typ testu vyvinul olomoucký Ústav molekulární a translační medicíny Univerzity Palackého ve spolupráci se soukromými firmami IntellMed a Aumed.
Člověk 20 až 30 vteřin kloktá tekutinu, kterou pak vyplivne do kalíšku se speciálním práškem. „Spolehlivost kloktacích odběrů je srovnatelná s výtěrem přes tyčinku.
Srovnávací studie ukázala, že rozdíl mezi oběma způsoby odběru je asi 3 až 3,5 procenta v citlivosti, což je statisticky nevýznamné číslo,“ upřesnil Marián Hajdúch, šéf projektu a ředitel olomouckého Ústavu molekulární a translační medicíny.
Kloktací test se již prodává. Jeho cena je podobná jako u klasického PCR testu. Zatím jsou tyto testy dostupné v Praze a postupně by se měly dostat do zbytku republiky. Podle autorů kloktacího testu je vhodný například pro onkologické pacienty se zhoršeným polykáním, menší děti nebo třeba pro instituce, kde je nutné opakované testování.
Ministr zdravotnictví Jan Blatný (za ANO) v pondělí uvedl, že uvažuje o testování některých školáků pomocí nových metod. Šéf resortu školství Plaga už dříve řekl, že doufá, že budou tyto testy k dispozici během několika týdnů.
SPADIA LAB poskytla zdarma pět set PCR testů ze slin do škol zdarma
Laboratoř SPADIA LAB ve spolupráci s Univerzitou Karlovou a její spin-off společností GeneSpector nabídla školám v Moravskoslezském, Olomouckém a Středočeském kraji vyzkoušet si zdarma nový PCR test ze slin skládající se ze zkumavky s tyčinkou.
V rámci pilotního programu se zjišťuje, jak nejlépe zajistit logistiku v případě zvýšeného zájmu o testování žáků.
Ta zahrnuje komunikaci se školou, zaškolení odpovědných pracovníků, nastavení elektronické komunikace pro přenos výsledků, načasování odběru v rámci výuky, transfer vzorků do laboratoře a jejich zpracování. V pilotní fázi vyčlenila laboratoř SPADIA LAB 500 kusů testovací sady.
Známé jsou už výsledky, které nepřinesly překvapivé výsledky. Celkem 98 % dětí a pedagogů bylo negativních, pouze 2 % z pětistovky testovaných mělo pozitivní test, což se očekávalo. Laboratoř SPADIA LAB vložila do pilotního projektu přibližně 2 miliony korun.
Výsledky v přehledné excelovské tabulce dodává laboratoř SPADIA LAB vedení škol tentýž den večer. Ředitelé si tyto informace mohou dohledat také prostřednictvím elektronického komunikačního systému laboratoře pod názvem Virtual Lab, k němuž dostali od laboratoře SPADIA LAB přístupový kód.
Novinka PCR testu ze slin spočívá v použití bezpečné odběrové soustavy – zkumavky Sarstedt s připravenou tyčinkou.„Tyčinka se vloží do úst a po dvou minutách se opatrně vloží zpět do zkumavky. Je to hygienické, jednoduché a pohodlné.
Tento PCR test je stejně spolehlivý jako dosavadní odběrové soupravy využívající štětičky pro výtěr z nosohltanu, pro jejich užití ovšem není nutný žádný odběrový tým ani kvalifikované sestry. Tato nová testovací sada nedráždí sliznice, a je tak mnohem pohodlnější pro pravidelný odběr,“ vypočítal přednosti zdravotní ředitel SPADIA LAB Mgr.
Lukáš Garčic
. Děti jsou schopné test udělat samy pod dohledem dospělé osoby podle přehledného návodu k použití.Možnost zapojit se do dobrovolného testování žáků a zaměstnanců uvítala Základní škola pro žáky s mentálním postižením z Frenštátu pod Radhoštěm v Moravskoslezském kraji. „Zástupce laboratoře předem přivezl veškerý materiál včetně obrázkového manuálu a jednorázových rukavic a zaškolil vedení školy, které následně proškolilo všechny zaměstnance.
Po zahájení výuky od 8 hodin jsme počkali 30 minut, abychom dodrželi požadavek po tuto dobu nejíst a nepít. Po půl deváté žáci, učitelé a asistenti společně každý na svém místě ve třídě otevřeli svou zkumavku označenou čárovým kódem, vložili do úst tyčinku, po 2 minutách tyčinku „vyplivli“ zpět do zkumavky a bylo hotovo.
Jednorázové rukavice, které měli všichni pro jistotu na rukou, jsme odložili na místě určeném pro tento odpad. Přestože jsme školou pro žáky s mentálním postižením, všichni zvládli samoodběr bez problému a večer už jsme měli potvrzeno, že ve škole nebyl v rámci tohoto testování žádný pozitivní vzorek,“ popsala ředitelka školy PaedDr.
Pavlína Palová.
Ve Středočeském kraji ve dvou základních školách ZŠ Petrovice u Sedlčan a ZŠ Propojení Sedlčany proběhl test u dětí prvních a druhých tříd a test podstoupili všichni pedagogové. „Reakce učitelů na způsob testování byla pozitivní a z jednoduchého průběhu byli nadšení.
O testu se dozvěděla další školská zařízení ve Středočeském kraji, která projevila zájem si ho vyzkoušet.
O našich aktivitách je průběžně informována hejtmanka Středočeského kraje, která je tomuto typu testu příznivě nakloněna,“ řekl obchodní ředitel pro Čechy SPADIA LAB Milan Škába s tím, že se připravuje ve spolupráci s vedením Prahy 6 v této části metropole testování ihned po jarních prázdninách.
V ZŠ a MŠ Řezníčkova v Olomouci podstoupilo test 113 osob, z toho 45 učitelů a zaměstnanců základní a mateřské školy. Speciální tyčinku si „požvýkali“ prvňáci a druháci. Učitelka Veronika Kopečná řekla, že děti zvládly test bezvadně a pozitivní ohlasy má také od rodičů. Prvňák Kuba bezprostředně reagoval: “Bylo to dobrý.
Mělo to takovou papírovou chuť, prostě tampón.“ Jeho spolužačka Sára přitakala: „Pro mě to bylo jednoduché. Nevadilo mi to. Lepší než strkání do nosu.“ Jirka si mírně postěžoval, že bylo těžší se strefit s tyčinkou zpět do zkumavky.
Z celkového počtu vyšli pouze tři pozitivní, a to jeden chlapec a dva zaměstnanci, kteří v době odběru neměli žádné příznaky. Proč ředitel ZŠ a MŠ Řezníčkova Mgr. Miloslav Palát kývl na nabídku testování: „Chtěl jsem zjistit, zda je škola zdrojem nákazy. Výsledky mě ujistily v tom, že není. To je jasný vzkaz vládě.
Již od října loňského roku čekáme na zprávy z ministerstva, kdy někdo začne testovat děti a zdůvodní tak nařízení dlouhodobého přerušení výuky. Učitelé se bojí, rodiče se bojí a děti sedí doma. Nikdo z úředníků nezkusil vybrat jedinou školu v každém kraji, aby se prokázalo, jak to s nákazou u školou povinných dětí skutečně je. A proč jsou školy tak dlouho zavřené.
Do výuky by se měl vrátit celý první stupeň nebo alespoň třetí třídy, aby byla zachována kontinuita vzdělávání na 1. stupni,“ uzavřel ředitel ZŠ a MŠ Řezníčkova v Olomouci Mgr. Miloslav Palát.
„Myslíme si, že naše odběry jsou nejvhodnější pro použití laické veřejnosti v tomto případě učiteli a zároveň jsou akceptovatelné pro děti. PCR testy se nemusí dělat tak často jako testy antigenní, stačí 1x za 10 až 14 dnů, takže jsou méně otravné.
Při využití naší metody PCR testu ze slin pomocí tyčinky nevzniká žádný biologický odpad, který by zatěžoval školy dalšími hygienickými předpisy. Díky nenáročnému odběru a snadnému transportu se nabízí využití pro účely masivnějšího testování ve školách.
V situaci, kdy stát nemá jasno a hejtmani to chtějí řešit, může být náš test pro kraje atraktivní,“ potvrdil ředitel SPADIA LAB RNDr. Martin Radina.
V rámci validační studie laboratoř SPADIA LAB porovnávala vzorky z nosohltanu a ze slin u několika stovek lidí. Výsledky jsou srovnatelné, odchylky se vyskytly při nedodržení některých doporučení, které zkreslují výsledek.
Například když si člověk zakouřil nebo použil žvýkačku před odběrem. „Navazujeme na úspěšnou spolupráci s naší dceřinou společností GeneSpector, která velmi pružně reaguje na aktuální pandemickou situaci a přináší efektivní řešení této krize.
Jsem rád, že opět můžeme být součástí přípravy testovacích kitů a podílet se na zlepšení ekonomické situace v naší společnosti,“ kvituje Otomar Sláma, ředitel CUIP hlavní výhody spojení vědy a komerčních partnerů.
Díky této nové metodě již v několika vyspělých evropských zemích mohou žáci bezpečně navštěvovat školy i školky.
SPADIA LAB je síť diagnostických laboratoří, která patří k největším poskytovatelům laboratorní medicíny v České republice. Provádí široké spektrum rutinních, vysoce specializovaných i unikátních vyšetření. Je akreditovanou laboratoří dle normy ČSN EN ISO 15189:2013. Rovněž je držitelkou oprávnění k testování COVID-19 vydaným ze strany Státního zdravotního ústavu.
PCR testy ze slin na COVID-19 od DIANA Biotechnologies úspěšně nasazeny v českých laboratořích
Praha, 11. února 2021
Stáhnout jako PDF
Přímé PCR testy ze slin od DIANA Biotechnologies byly notifikovány pro klinickou diagnostiku COVID-19 u Státního ústavu pro kontrolu léčiv (SÚKL).
Už nyní je úspěšně používá několik českých laboratoří a jejich kapacita se postupně navyšuje tak, aby byly brzy dostupné po celé ČR.
Díky mimořádné přesnosti jsou testy ze slin vhodné k diagnostickému testování a plnohodnotně nahrazují doposud nejrobustnější PCR testy ze stěru z nosohltanu. Unikátní diagnostika také umožňuje laboratořím rozpoznat, zda je testovaný nakažen tzv. britskou mutací COVID-19.
Václav Navrátil, CEO DIANA Biotechnologies: „Naše PCR testy ze slin jsou příjemnější, jednodušší a rychlejší oproti dosavadním PCR testům stěrem z nosohltanu. Přitom se i v praxi potvrzuje, že jsou přinejmenším stejně spolehlivé a dokonce jsou citlivější než testy ze stěrů.
Zároveň umožňují samoodběr, u kterého není potřeba odborně vyškolený personál. Díky tomu je můžeme využít k pravidelnému testování v nemocnicích, firmách i ve školách a zamezit tak šíření nákazy v kolektivech. Pravidelné testování je jednou z klíčových cest ke zvládnutí pandemie.
“
Přímé PCR testy ze slin od DIANA Biotechnologies prošly důkladnou validační studií a byly následně notifikovány pro klinickou diagnostiku u SÚKL. Díky notifikaci CE IVD nyní mohou být využívány k diagnostice COVID-19 i v rámci celé EU a v dalších státech uznávajících CE IVD.
Martin Dienstbier, finanční ředitel DIANA Biotechnologies: „Naše testy ze slin již standardně využívají laboratoře AGELLAB na několika odběrových místech na Moravě, v pilotním provozu nyní testy ze slin zavádějí i pražské laboratoře PREVEDIG, GHC Genetics a VIDIA Diagnostika.
Zájem registrujeme od mnoha dalších diagnostických laboratoří v Česku i zahraničí. Díky pokročilé automatizaci může při plném vybavení každá laboratoř otestovat až pět tisíc vzorků denně. S rostoucím zájmem zvedáme také výrobní kapacity a jsme připraveni produkovat miliony testů měsíčně.
“
Jak PCR testy ze slin DIANA Biotechnologies fungují
Samoodběr slin je velmi jednoduchý a nevyžaduje přítomnost odborného personálu. Pacient si nejdříve mírně odkašle do roušky a poté si odplivne do speciální zkumavky s náustkem, která je označena unikátním kódem pro identifikaci vzorku. Tu zašroubuje a bezpečně uzavřenou zkumavku předá personálu na odběrovém místě.
Vzorky lze transportovat do laboratoře v kompaktním stojánku o rozměrech pouze cca 9x13x6 cm, do kterého se vejde až 96 vzorků. V laboratoři probíhá analýza s vysokou mírou automatizace a paralelizace. Zda je pacient pozitivní či negativní, ukáže PCR přístroj do 1,5 hodiny.
Narozdíl od ostatních PCR testů není nutná přístrojově náročná izolace virové RNA, která PCR testům obvykle předchází. Díky tomu je celý proces testování rychlejší a robustnější.
Jak PCR testy ze slin DIANA Biotechnologies rozlišují britskou mutaci COVID-19
„Naše PCR testy ze slin zároveň umí určit, zda je testovaný nakažen tzv. britskou mutací COVID-19. Testy jsou navrženy tak, aby detekovaly dva různé úseky genetické informace viru.
V našem případě jedna z detekovaných sekvencí je navržena tak, že je odlišná právě a jen v britské variantě, a proto ji testy umožňují rozlišit. Díky vhodnému návrhu soupravy je možné britskou variantu detekovat přímo v PCR testu, přičemž ale citlivost testu zůstává nezměněna.
V ČR je tak díky našim testům možné monitorovat šíření britské varianty COVID-19 prakticky v reálném čase,“ vysvětluje Václav Navrátil, CEO DIANA Biotechnologies.
Validační studie
Společnost v listopadu spolehlivost PCR testů ze slin ověřila validační studií ve spolupráci s Nemocnicí Na Bulovce. Jednalo se o jednu z největších a nejlépe kontrolovaných studií diagnostiky COVID-19 v ČR.
Vědci porovnali párové vzorky stěru z nosohltanu a slin u 494 pacientů. Pozitivních případů bylo ze stěrů odhaleno 105, zatímco ze slin 109. Podle studie jsou PCR testy ze slin přinejmenším srovnatelně citlivé jako PCR testy stěrem z nosohltanu.
Nejnovější výsledky z praxe ukazují, že testy ze slin jsou dokonce citlivější než testy z nosohltanu.
„PCR testy ze slin zachytily v klinické studii dokonce o několik nakažených více než ty z nosohltanu. Očekáváme, že v reálném provozu bude rozdíl v záchytech ještě výraznější, protože odpadá proces odběru stěrů, ve kterém se často chybuje.
Testy ze slin také umožňují pravidelné testování vybraných skupin, jako jsou zaměstnanci firem či studenti. Díky jejich citlivosti, která je až o několik řádů vyšší než u antigenních testů, dokáží odhalit i slabé virové nálože při začínající infekci několik dní před příznaky.
Při pravidelném testování je tak možné infikované izolovat dříve, než se stanou vysoce infekčními pro své okolí a zabránit tak dalšímu šíření nákazy v kolektivu.
Zbytek kolektivu by v případě pravidelných testů ze slin nemusel putovat do karantény,
“ uvádí Václav Navrátil, CEO DIANA Biotechnologies.O COVID-19 testech firmy DIANA Biotechnologies
DBdirect PCR testy ze slin i ze stěrůUltra citlivé PCR testy ze slin od DIANA Biotechnologies jsou založeny na technologii DBdirect využívající metodu přímého RT-PCR DBdirect, která nevyžaduje izolaci RNA v separátním kroku.
To znamená, že je vzorek slin nebo stěrů přímo přidán do PCR roztoku a laboratorní proces je jednodušší a rychlejší oproti dosavadní používané izolační metodě. Nová metoda také eliminuje nutnost složité automatizace potřebné k izolaci RNA a k provedení testu stačí jakýkoliv standardní qPCR přístroj.
Přímé PCR testy ze slin jsou tak vhodné jak pro velké laboratoře s automatizovaným zpracováním vzorků, tak i pro ruční zpracování vzorků. Díky tomu, že PCR metoda je dnes běžně používaná, bude transformace na testy ze slin pro laboratoře jednoduchá.
Metoda má certifikaci CE IVD a lze ji používat k diagnostice v zemích EU, zemích EFTA, Švýcarsku, Turecku a dalších zemích uznávajících CE IVD.
Standardní PCR testy ze stěrů s izolací RNAFirma DIANA Biotechnologies v prvním pololetí 2020 vyvinula ultracitlivé testy na COVID-19, se kterými vyhrála hackathon Hack the Crisis. Ty jsou založeny na dosud nejlepší ověřené metodologii využívající stěry z nosohltanu, izolaci virové RNA a RT-PCR detekci.
Patří k nejcitlivějším na trhu, dokážou ve vzorku detekovat jednotky virových částic, navíc se vyznačují značnou robustností. DIANA Biotechnologies k těmto testům dodává přístroj pro automatizaci, který umožňuje zpracování přes 1 000 vzorků denně.
Testy byly validovány a jsou nyní používány i v největších českých státních i soukromých testovacích centrech jako je Zdravotní Ústav v Ostravě, Nemocnice Na Bulovce v Praze, Laboratoře Agel v Ostravě, GHC Genetics v Praze a dalších. Celkem již bylo na této platformě od srpna provedeno více než 600 tisíc testů.
Metoda má certifikaci CE IVD a lze ji používat k diagnostice v zemích EU, zemích EFTA, Švýcarsku, Turecku a dalších zemích uznávajících CE IVD.
O firmě DIANA Biotechnologies
Místo odběrů z nosu stačí plivnout. Laboratoře zkouší unikátní metodu testování na koronavirus
„Několik měsíců se testujeme, dokonce třikrát týdně, což myslím, že kdybychom dělali testy z nosohltanu, tak už nám většina zaměstnanců dala výpověď.
Ale u těchto nových testů je to možné a díky jejich citlivosti opravdu prakticky zaručí, že se vám žádná infekce nerozvine,“ přiblížil Českému rozhlasu Plus vlastní zkušenost provozní ředitel společnosti Diana Biotechnologies Martin Dienstbier.
Váš prohlížeč nepodporuje přehrávání audia.
Jak funguje unikátní metoda odběru vzorků na covid-19? Dozvíte se v reportáži
„Máme samozřejmě případy zaměstnanců, kteří byli infikováni, ale v podstatě vždycky se infekce odhalila v raném stadiu, několik dnů před příznaky, takže byli z kolektivu izolováni a nikdy jsme tady neměli přenos v rámci firmy. A tohle si myslíme, že je model, který je využitelný ve firemních kolektivech, tak případně ve školách, v lékařském personálu a tak podobně,“ řekl.
Tato unikátní metoda ze slin tak může být alternativou současných testů, založených na výtěru z nosohltanu, ale zároveň může fungovat i jako preventivní screeningový test.
A to už ředitel a především vědecký mozek společnosti Václav Navrátil bere do rukou jednoduchou odběrovou sadu, která na první pohled vypadá jako malý trychtýř.
„Tady vidíte odběrovou sadu, rozbalím jí. A ta se skládá ze zkumavky, trychtýřku, který našroubujete na zkumavku. Dá se do toho plivnout, stačí malý objem, a poté trychtýřek zahodíte, zkumavku zašroubujete. Už z výroby má na sobě kód na naskenování a do laboratoře putuje ve stojáncích,” popsal.
Zkumavka má asi pět centimetrů na výšku a půl centimetru na šířku. „To se dá dát do malých kompaktních stojánků, kam se jich vejde 96 a v laboratoři jsou stroje, které odšroubují a naskenují všechny vzorky najednou a analýza už je potom v podstatě jednoduchá, připraví se tam reagencie do destičky, přidá se vzorek a analyzuje se to,” vysvětlil.
I v tomto případě se analýza provádí pomocí metody PCR, která je považována za zlatý standard, ovšem mladí výzkumníci ji už dříve vylepšili. Při jejich technologii DB Direkt odpadá izolace RNA a samotná analýza probíhá pouze v jediném kroku, což je rychlejší i levnější.
Otazníky kolem testování ve školách: Neprůhledné firmy v tendru na dodavatele, pochybnosti ve výběru testů
Číst článek
„My jsme kompletně předělali chemii, která je používaná pro PCR test, aby všechny kroky zvládla najednou. Už není nutné čistit vzorek, nevadí sliny nebo rýma, tedy to, co je v tom vzorku. Díky tomu se to dá udělat jednou a přeskočit krok,” vysvětlil Navrátil. „Je to naše unikátní technologie, dokonce na to máme v Americe podaných několik patentů,” doplnil.
Srovnávací studie ukázaly, že odběry ze slin jsou citlivější než odběry z nosohltanu tedy, že odhalí více pozitivních jedinců. U tyčinek totiž podle Martina Dienstbiera velmi záleží na tom, jak dobře se samotný stěr z nosu udělá.
„Ty stěry nejsou jednoduché a ta kvalita odběru se velmi liší. Když máte velmi dobře vyškolený personál, tak výsledky ze stěrů a slin jsou srovnatelné. Ale v reálném světě je odběr slin robustní, kdežto u těch stěrů hodně závisí, jak se to ten daný den odebere a můžete tam mít falešné negativity, protože ten stěr není správně odebrán,” popsal.
Jediná podmínka k odběru
Rozdíl mezi kloktacími testy, které jsou už na trhu a testy ze slin je v tom, že se vzorek ničím neředí ani nijak neupravuje. Podle Navrátila mají testy jedinou podmínku, či spíše doporučení.
V Sedlčanech začali zkušebně testovat školáky na koronavirus. Iniciovala to tamní zubařka
Číst článek
„To, co my požadujeme je deset minut před tím nejíst, nepít a nekouřit, což není problém. A doporučujeme si předtím odkašlat, čímž se zvýší šance. I bez toho ten test ale funguje,” řekl.
Samotná PCR analýza trvá stejně dlouho, tedy zhruba hodinu a půl, výsledky bývají do 24 hodin. Už teď některé laboratoře dávají lidem vybrat, jestli chtějí odběr z nosohltanu anebo ze slin a podle očekávaní si vybírají tu příjemnější variantu.
Výroba odběrových trychtýřků zatím nabíhá, v únoru jich Diana Biotechnologies vyrobí tři sta tisíc, v březnu dvakrát tolik a výrobu bude dále navyšovat.
Otázka ceny celého testu je záležitostí nároků výrobce a laboratoře. Už teď se podle Martina Dienstbiera díky automatizaci cena laboratorní analýzy snížila z 1500 na zhruba 1000 korun a je tady podle něj ještě velký prostor k poklesu.
„Na Slovensku už domlouváme možnost tzv. půlování, kdy se smíchá více vzorků do jednoho a ten se analyzuje. Cena by se tak mohla dostat i ke 300 korunám, což je už srovnatelné jako u antigenních testů, ale stále to bude výrazně citlivější.”
Vzhledem k tomu, že výsledek odpovídá standardu PCR, stačí jej provádět jednou týdne. A to už pak může být zajímavá varianta testů pro školy i firmy.
Bez výtěru z nosohltanu. Nový typ testu na covid by měl být k dispozici v lednu
Koronavirus na Kladensku ČTK
V Česku by měl být během ledna k dispozici nový typ testu na covid-19, u něhož při odběru vzorku nepoužívá výtěr z nosohltanu. Řekl to ředitel a hlavní vývojář firmy Diana Biotechnologies Václav Navrátil. Test, který společnost sídlící ve Vestci u Prahy vyvinula, využívá sliny.
Vědec Václav Navrátil. | Foto: ČTK
Před několika týdny byl uveden také test vzešlý ze spolupráce Ústavu molekulární a translační medicíny Univerzity Palackého v Olomouci (UMTM UP) a soukromé sféry. Při tomto neinvazivním odběru člověk kloktá tekutinu, kterou pak vyplivne do kalíšku se speciálním práškem.
Metody odběrů vzorků ze slin a pomocí kloktání mají nahradit běžný a pro mnohé nepříjemný výtěr nosohltanu štětičkou. Cílí i na ty, kteří podstupují testování pravidelně a opakovaně. Vzorky jsou pak vyšetřeny v laboratořích metodou PCR.
Přečíst článek ›
„Nyní finalizujeme uvedení do praxe ve vybraných laboratořích, během ledna by testy měly být k dispozici,“ uvedl k testům ze slin Navrátil. Dodal, že zájem je ze strany státních institucí, firem i veřejnosti.
Společnost nyní dovede připravit statisíce testů měsíčně. „Samotných testů už vyrobíme více, ale postupně nabíhá výroba odběrových sad,“ upřesnil.
Dodal, že o spolupráci společnost jedná primárně s diagnostickými laboratořemi.
Navrátil už dříve řekl, že testy ze slin mají srovnatelnou citlivost s těmi, které využívají standardní postup. Firma je otestovala ve spolupráci s Fakultní nemocnicí Bulovka.
Podle vědce také u testů vyvinutých ve Vestci není nutné samostatně izolovat virovou RNA, což je nejtěžší krok analýzy. Výsledná cena bude pro testované zhruba stejná jako u ostatních PCR testů.
„Jako výrobci finální cenu neurčujeme, to je v režii laboratoří a pojišťoven,“ dodal.
Pro snazší a šetrnější odběr vzorků u onkologických pacientů trpících problémy se sliznicí byl na Univerzitě Palackého původně vyvíjen test, který využívá kloktání. Podle projektového manažera UMTM Petera Vanka ho nyní využívají, nebo o něj mají zájem například umělecké soubory, které podstupují testování opakovaně.
Přečíst článek ›
Podle Lubomíra Němce ze společnosti IntellMed, která produkt vyrábí, nyní firma může vyrobit 70 tisíc až 100 tisíc kusů měsíčně. „Pokud by byla poptávka větší, než je výrobní kapacita, jsme schopni ji v průběhu dvou, tří týdnů navýšit na dvojnásobek,“ poznamenal.
Na dotaz ohledně počtu distribuovaných testů Němec uvedl, že jde zatím asi o tři tisíce kusů. „Zahájili jsme to teprve v období vánočních svátků,“ podotkl. Nyní firma řeší spolupráci s laboratořemi připravenými zpracovat takto získané vzorky. Vanek doplnil, že jako nadstandard testování touto formou nabízí také i z laboratoří v Praze a samoodběrová sada by měla být dostupná i na internetu.